Tähän sivulle on koottu korkeakouluyhteisön tarjontaa tutkimuksen IT:n näkökulmasta. Lisätietoja ja tarkempia kuvauksia löydät IT-käsikirjasta.

 

Datanhallinnan IT-tuki| Laskennan ja prosessoinnin tuki| Ohjelmistoinfran ja IT-infran tuki | FAQ

 

Datanhallinnan IT-tuki

Tarjoamme korkeakouluyhteisön tutkijoille tietoteknisiä palveluja tutkimuksen koko elinkaaren ajalle. Löydät kuvauksen vakiopalveluistamme IT-käsikirjasta. Jos sinulla on jotain erityistarpeita, ota yhteyttä it-helpdesk@tuni.fi – katsotaan yhdessä, miten voimme edistää asiaa. Tutkimuksen IT-tarpeisiin erikoistuneita asiantuntijoita löytyy Hervannan-  ja Kaupin kampukselta, sekä keskustastakampukselta.

Löydät näiltä sivuilta korkeakouluyhteisön omien palvelujen lisäksi poimintoja yhteistyökumppaniemme tarjonnasta. Autamme mielellämme tarpeeseen sopivan palvelun valitsemisessa ja toimimme tarvittaessa yhteytenä esimerkiksi CSC:n suuntaan.

Muista tutkimuksen palveluista löydät tietoa mm. seuraavilta sivuilta:

 

Ratkaisuvaihtoehtoja datan tallennuspaikaksi

 

Korkeakouluyhteisömme käytössä on erilaisiin tarpeisiin soveltuvia tallennuspaikkoja, joista alla yhteenveto (tarkemmat kuvaukset löytyvät intrasta).

  • Ryhmä- ja projektihakemistot
    • Ryhmä- ja projektihakemistot tarjoavat varmistetun yhteisen tallennustilan tutkimusryhmien työskentelyalustaksi. Käyttö vaatii TUNI-tunnuksen. Tiedostot varmuuskopioidaan automaattisesti.
  • IDA ja Fairdata-kokonaisuus
    • IDA on opetus- ja kulttuuriministeriön järjestämä turvallinen ja jatkuva Fairdata-kokonaisuuteen kuuluva tallennuspalvelu, joka on käyttäjilleen maksuton. Tallennustilaa yhteensä satoja teratavuja. Suunniteltu erityisesti tutkimusdatan säilytykseen, ja Fairdata-PAS –palvelun kautta myös pitkäaikaissäilytykseen.
  • Tallennustila virtuaalipalvelimelta
    • Virtuaalipalvelimia voi tilata tallennustarpeisiin tai muuhun käyttöön tietohallinnon virtuaalipalvelinklusterista. Virtuaalipalvelin voidaan räätälöidä tarpeen mukaan, joten se sopii monenlaisiin tietojenkäsittely- ja tallennustarpeisiin. Se soveltuu myös normaalia suurempien aineistojen säilytykseen.
  • Yksittäistä tutkimusta varten hankittava erillinen fyysinen palvelin
    • Tietohallinto auttaa tarvittaessa palvelinten hankinnoissa ja tarjoaa asiakkaiden palvelimille hosting-palvelua Tampereen korkeakouluyhteisön palvelinsaleissa. Omia palvelimia hankitaan tyypillisesti tapauksissa, joissa mikään muu palvelu ei vastaa tarpeeseen, esim. erittäin suurten aineistojen tallennukseen.
  • OneDrive for Business (Personal)
    • OneDrive on pilvitallennuspalvelu missä voit myös jakaa tiedostoja ilman rajoituksia. Tallennustilan koko on 1 Tt.

 

Laskennan ja prosessoinnin tuki

Tarjoamme korkeakouluyhteisön tutkijoille tietoteknisiä palveluja tutkimuksen koko elinkaaren ajalle. Löydät kuvauksen vakiopalveluistamme IT-käsikirjasta. Jos sinulla on jotain erityistarpeita, ota yhteyttä it-helpdesk@tuni.fi – katsotaan yhdessä, miten voimme edistää asiaa. Tutkimuksen IT-tarpeisiin erikoistuneita asiantuntijoita löytyy Hervannan-  ja Kaupin kampukselta, sekä keskustastakampukselta.

Löydät näiltä sivuilta korkeakouluyhteisön omien palvelujen lisäksi poimintoja yhteistyökumppaniemme tarjonnasta. Autamme mielellämme tarpeeseen sopivan palvelun valitsemisessa ja toimimme tarvittaessa yhteytenä esimerkiksi CSC:n suuntaan.

Muista tutkimuksen palveluista löydät tietoa mm. seuraavilta sivuilta:

 

Millaista laskentakapasiteettia on tarjolla?

Tarjoamme laskennan ja prosessoinnin tukea tilanteissa, joissa oma tietokone/kannettava käy laskennan ja prosessoinnin tarpeisiin liian tehottomaksi, esimerkiksi laskenta-analyysi kestää useita tunteja estäen tietokoneen muun käytön, tai RAM-muisti/tallennustila osoittautuu riittämättömäksi.

Voimme auttaa siirtämään laskennan johonkin muuhun laskentaympäristöön. Käytettävissä on kolmentasoisia laskentaympäristöjä, jotka muodostavat eurooppalaisessa mittakaavassa tieteellisen laskennan kokonaisarkkitehtuurin:

  • Matalin taso (Tier-2) on yliopiston laskentakeskuksen (TCSC) ylläpitämä laskentaympäristö, johon jokainen yliopiston tutkija voi saada käyttöoikeuden. Käyttölupahakemukselle on oltava esimiehen hyväksyntä, esimerkiksi väitöskirjatyön tekijä tarvitsee oman ohjaajansa puollon. Tukea voidaan tarjota myös pienelle määrälle opiskelijoita esimerkiksi lopputyövaiheessa tai tietyllä opintojaksolla.
  • Seuraavan tason (Tier-1) muodostaa CSC:n kansallinen laskentakeskus, joka vastaa suurempiin laskentatarpeisiin. Käyttäjätunnuksen CSC:n laskentaympäristöön voi saada kuka tahansa suomalaisessa yliopistossa työskentelevä tutkija, ja siihen sisältyy jonkin verran laskentakapasiteetin käyttöoikeutta. Suuremmat laskentakapasiteettitarpeet edellyttävät kansallisen tason tieteellistä arviointia tutkimushankkeesta.
  • Korkeimman tason (Tier-0) muodostaa eurooppalainen PRACE-kollaboraatio. Laskentaresurssien saaminen sieltä edellyttää kansainvälisen tason tieteellistä arviointia tutkimushankkeesta.

(Tier-2 tarkoittaa yleisesti 1.000+ CPU-ytimen laskentakeskusta, Tier-1 tarkoittaa 10.000+ CPU-ydintä, ja Tier-0 tarkoittaa 100.000+ CPU-ydintä.)

Mikäli laskenta ei ole siirrettävissä em. tieteelliseen laskentaan erikoistuneisiin ympäristöihin, voidaan harkita virtuaalipalvelinta, tai tutkimuksen budjetin salliessa ulkoisen pilvipalvelukapasiteetin ostamista.

Vaihtoehto edellä esitetyille ulkoisille laskentaympäristöille on esimerkiksi algoritmien tehostaminen, laskennan rinnakkaistaminen, tallennuskapasiteetin lisääminen tai toisen ohjelmiston valitseminen laskennan käyttöön. Tutkimuksen budjetin salliessa voidaan myös harkita tehokkaamman työaseman hankkimista.

Laskennan ja prosessoinnin tuki on tarjolla tutkijoille ja tutkimusryhmille.

Jos tarvitset apua laskentaan ja prosessointiin liittyen, ota yhteyttä it-helpdesk@tuni.fi.

 

Ohjelmistoinfran ja IT-infran tuki

Tarjoamme korkeakouluyhteisön tutkijoille tietoteknisiä palveluja tutkimuksen koko elinkaaren ajalle. Löydät kuvauksen vakiopalveluistamme IT-käsikirjasta. Jos sinulla on jotain erityistarpeita, ota yhteyttä it-helpdesk@tuni.fi – katsotaan yhdessä, miten voimme edistää asiaa. Tutkimuksen IT-tarpeisiin erikoistuneita asiantuntijoita löytyy Hervannan-  ja Kaupin kampukselta, sekä keskustastakampukselta.

Löydät näiltä sivuilta korkeakouluyhteisön omien palvelujen lisäksi poimintoja yhteistyökumppaniemme tarjonnasta. Autamme mielellämme tarpeeseen sopivan palvelun valitsemisessa ja toimimme tarvittaessa yhteytenä esimerkiksi CSC:n suuntaan.

Muista tutkimuksen palveluista löydät tietoa mm. seuraavilta sivuilta:

Tutkimusryhmät ja tutkijat saavat ohjelmisto- ja IT-infran tukipalvelusta  tukea tutkimuksen erikoisohjelmistojen hankintaan ja asennukseen koneelle. Kysy tarvittaessa apua myös ohjelmiston valintaan.

Palveluun kuuluu tarvittava levytila tutkimuspalvelimille keskitetystä levyjärjestelmästä sekä tallennusverkkoyhteys, jolla palvelimet kytketään levyjärjestelmään. Varmuuskopiointi ei sisälly palveluun.

Osa palveluista on maksullisia.

Jos tarvitset apua tutkimuksen erikoisohjelmistoihin liittyen, ota yhteyttä: it-helpdesk@tuni.fi.

 

FAQ

Mistä löydän tietoa muista tutkimuksen tietoteknisistä palveluista, kuin korkeakouluyhteisön tarjoamista?

Autamme mielellään palveluiden valitsemisessa ja käytössä, sekä toimimme tarvittaessa yhteystahona esimerkiksi CSC:n suuntaan. Toteutamme palveluita myös pyynnöstä, joten jos etsimääsi ei löydy täältä, ota yhteyttä: it-helpdesk@tuni.fi.

Tutkimuksen suunnittelu ja työskentely-ympäristöt

  • Avoin tiede ja tutkimus – avointiede.fi
    Avoin tiede ja tutkimus -hanke on opetus- ja kulttuuriministeriön vuonna 2014 käynnistämä hanke tiedon saatavuuden ja avoimen tieteen edistämiseksi. Sivustolta löytyy ATT-projektin tavoitteita, keskeisiä linjauksia sekä avoimen tieteen kansallisia palveluja. ATT:n palvelut ovat kaikkien käytettävissä.
  • CSC:n tutkijan palvelut – research.csc.fi
    Sivustolta löytyy tietoa tutkimuskäytännöistä sekä CSC:n tarjoamista palveluista tutkimuksen tekoon.
  • Funet FileSender – filesender.funet.fi
    Funet FileSender on erityisesti suurikokoisten tiedostojen lähettämiseen erikoistunut selainpohjainen palvelu. Palvelu ei sovi tiedostojen pitkäaikaissäilytykseen, vaan ne pysyvät palvelussa vain tietyn määräajan. Funet FileSenderiä pääsee käyttämään Haka-käyttäjätunnistuksen kautta.

Datan tuottaminen ja keruu

  • AVAA – avaa.tdata.fi
    AVAA on avointen aineistojen julkaisualusta, jonka avulla voi tarkastella ja yhdistellä erilaisia tutkimusaineistoja. AVAA-alustalla on julkaistu erilaisia sovelluksia, joiden kautta voi esim. tarkastella saastepilvien leviämistä karttapohjalla ja käyttää avoimia palkkatietoaineistoja rajapintapalveluiden kautta.
  • Aila-palveluportaali – services.fsd.uta.fi
    Tietoarkiston Aila-palveluportaalissa voi hakea ja selata Tietoarkistoon tallennettuja tutkimusaineistoja. Rekisteröityneet asiakkaat voivat myös ladata aineistoja.
  • B2FIND – eudat.eu/services/b2find
    B2FIND-palvelun avulla voidaan etsiä tietoa ja aineistoja kuvailevan tiedon eli metatiedon avulla. B2FIND on osa EUDAT-projektia, jonka tavoite on jakaa ja säilyttää dataa luotettavalla tavalla yli rajojen. B2FIND-palvelun hakuominaisuuksien käyttö on avoinna kaikille.
  • B2SHARE – b2share.eudat.eu
    B2SHARE-alustalla voi selata sinne ladattua tietoa sekä julkaista omaa tutkimustietoaan. Palveluun ladatut aineistot ovat kaikkien käytettävissä ja selattavissa, ja ladatakseen palveluun tietoa tulee sinne rekisteröityä yliopiston tunnuksella.
  • Etsin – etsin.avointiede.fi
    Etsin-palvelu hakee tutkimusaineistoa kuvailevan tiedon, eli metatiedon, avulla. Etsin kertoo myös, miten aineisto on löydettävissä ja käytettävissä. Etsin on osa opetus- ja kulttuuriministeriön Avoin tiede ja tutkimus –palveluita, ja se on vapaasti käytettävissä. Tietoarkistoon tallennettujen aineistojen kuvailutiedot siirtyvät automaattisesti Etsimeen.
  • Kielipankki – kielipankki.fi
    Kielipankki on palvelukokonaisuus kieliaineistoja käyttäville tutkijoille. Kielipankissa on eri tavoin jäsenneltyä aineistoa yli 60 kielellä. Sen kautta voidaan myös helposti jakaa aineistoja muiden tutkijoiden käyttöön. Osaa kielipankin aineistosta voi käyttää ilman kirjautumista, osaa taas korkeakoulun tunnuksilla kirjautumalla. Jotkin aineistot voivat myös vaatia henkilökohtaisen käyttöoikeuden, jota voi hakea Eduuni-tunnuksella.
  • PaiTuli – csc.fi/paituli
    Paituli on paikkatietoaineistojen latauspalvelu yliopisto- ja korkeakouluopiskelijoille sekä –tutkijoille. Palvelu on käytettävissä Haka-tunnistautumisella.
  • Tilastopalvelu Vipunen – vipunen.fi
    Vipunen on opetushallinnon tilastopalvelu, joka on toteutettu avoimella lähdekoodilla. Vipuseen on koottu tilastotietoja, jotka perustuvat Tilastokeskuksen, opetus- ja kulttuuriministeriön, Opetushallituksen sekä CIMO:n (Kansainvälisen liikkuvuuden ja yhteistyön keskus) keräämiin tietoihin.

Datan analysointi ja tallentaminen

  • Chipster – chipster.csc.fi
    Chipster on avoimen lähdekoodin bioinformatiikkaohjelmisto. Palvelu on erityisen hyödyllinen bio- ja lääketieteen tutkijoille, ja se tarjoaa yli 300 työkalua NGS-, siru-, proteomiikka- ja sekvenssidatan analysointiin. Chipsterin saa käyttöön rekisteröitymällä CSC:n asiakkaaksi (Haka-tunnistautuminen). Chipsterin käyttö on suomalaisille yliopistoille ja ammattikorkeakouluille maksutonta.
  • CSC:n laskentapalvelut – research.csc.fi/computing-infrastructures
    CSC tarjoaa kattavat laskentapalvelut erilaisiin tarpeisiin akateemisille instituutioille. CSC:n laskentapalvelut ovat Pohjois-Euroopan kärkiluokkaa. Laskentapalveluiden käyttöoikeutta haetaan CSC:n kautta.
  • CSC:n tietokantapalvelut
    CSC tarjoaa erilaisia tietokantapalveluja tutkimuksen tueksi. Tietokantapalvelujen käyttöoikeuksia haetaan CSC:n sivustolla erikseen.

  • Elmer – csc.fi/elmer
    Elmer-ohjelmisto on avoimen lähdekoodin ohjelmisto osittaisdifferentiaaliyhtälöiden ratkaisuun, ja se soveltuu erityisen hyvin monifysikaalisten ilmiöiden mallintamiseen.
  • IDA  avointiede.fi/ida
    IDA on turvallinen ja helppokäyttöinen tutkimusdatan säilytyspalvelu, jota voi käyttää useilla eri käyttöliittymillä. Data talletetaan palvelussa projekteihin, ja käyttäjä voi olla osana useita eri projekteja. IDA:an siirretty palvelu tarkistetaan haittaohjelmien varalta, ja se myös varmuuskopioidaan. Palveluun kirjaudutaan Haka-tunnistautumalla, jonka jälkeen projektin luonut henkilö voi hakea IDA-säilytystilaa.
  • Pouta – pouta.csc.fi
    Pouta-pilvipalvelun avulla voidaan toteuttaa monenlaisia laskentahankkeita, myös sellaisia, jotka eivät aiemmin ole olleet CSC:n muilla koneilla mahdollisia. Palvelu hyödyntää pilviteknologiaa sekä Taito-superklusterin kapasiteettia. Palvelua käyttääkseen tulee olla rekisteröitynyt CSC:n asiakkaaksi (Haka-tunnistautuminen) sekä ottanut käyttöön Pouta-pilviresurssit tutkijan käyttöliittymästä (sui.csc.fi).Vaikka kone on CSC:n konesalissa, sille voidaan lisätä .tuni.fi-muotoa oleva osoite.
  • SUI (Scientist’s User Interface) – sui.csc.fi
    Scientist’s User Interface on CSC:n portaali, jonka kautta pääsee helposti käyttämään useita eri CSC:n työkaluja, sekä hakemaan niihin käyttöoikeuksia. Palveluun kirjaudutaan Haka-tunnistautumalla.

Datan julkaiseminen ja jakaminen

  • AVAA – avaa.tdata.fi
    AVAA-alustalla voi julkaista tutkimusaineistoja sekä sovelluksia, jonka jälkeen niitä voi hyödyntää kuka tahansa ilman kirjautumista. Aineiston alustalle vienti vaatii Haka-tunnistautumisen sekä palvelun tuottajan myöntämät käyttöoikeudet palvelimelle. Haka-tunnistautumisen kautta kirjautumisen jälkeen omaa aineistoaan tai sovellustaan voi ehdottaa julkaistavaksi alustalla ottamalla yhteyttä CSC:n asiakaspalveluun.
  • Aila-palveluportaali – services.fsd.uta.fi
    Tietoarkiston Aila-palveluportaalissa voi hakea ja selata Tietoarkistoon tallennettuja tutkimusaineistoja. Rekisteröityneet asiakkaat voivat myös ladata aineistoja.
  • B2FIND – eudat.eu/services/b2find
    B2FIND-palvelun avulla voidaan etsiä tietoa ja aineistoja kuvailevan tiedon eli metatiedon avulla. B2FIND on osa EUDAT-projektia, jonka tavoite on jakaa ja säilyttää dataa luotettavalla tavalla yli rajojen. B2FIND-palvelun hakuominaisuuksien käyttö on avoinna kaikille.
  • B2SHARE – b2share.eudat.eu
    B2SHARE-alustalla voi selata sinne ladattua tietoa, sekä julkaista omaa tutkimustietoaan. Palveluun ladatut aineistot ovat kaikkien käytettävissä ja selattavissa, ja ladatakseen palveluun tietoa tulee sinne rekisteröityä yliopiston tunnuksella.
  • Etsin – etsin.avointiede.fi
    Tutkijat, tutkimusryhmät ja organisaatiot voivat julkaista Etsin-palvelun avulla tietoja omista aineistoistaan ja täten tarjota niitä käyttöön muillekin. Palvelussa julkaistut tiedot ovat kaikille avoimia. Haka-tunnistautumisen kautta kirjautumalla pääsee palveluun lisäämään tietoa omista tutkimusaineistoistaan, ja tiedot ovat kenen tahansa selattavissa. Tietoarkistoon tallennettujen aineistojen kuvailutiedot siirtyvät automaattisesti Etsimeen.

IT Helpdesk
0294 520 500
it-helpdesk@tuni.fi